Gra koncentruje się na trybie multiplayer, więc nie oferuje rozbudowanej fabuły. Zgodnie z tytułem, produkcja osadzona jest w uniwersum znanym z komiksowej serii Naruto, łączącym elementy średniowiecznej Japonii, fantasy oraz współczesnych technologii. Gracze wcielają się w dysponujących nadludzkimi zdolnościami wojowników ninja i biorą udział w bitwach niewielkich oddziałów.
Naruto to Boruto: Shinobi Striker to sieciowa gra akcji, w której dwie, maksymalnie czteroosobowe, drużyny ścierają się na zamkniętych arenach. Gracze mogą wybierać z obszernej galerii znanych z komiksu i jego animowanych adaptacji postaci. Znajdziemy wśród nich takich bohaterów jak Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiha, Sakura Haruno, Kakashi Hatake, Pain, Konan, Itachi Uchiha czy Kisame Hoshigaki. Każdy z nich dysponuje odmiennymi zdolnościami, uzbrojeniem oraz umiejętnościami specjalnymi.