My Hero One’s Justice 2 jest kontynuacją wydarzeń z poprzedniczki. Całość została oparta na mandze My Hero Academia oraz jej animowanej adaptacji emitowanej od 2016 roku. Akcja gry rozgrywa się w wymyślonej przez Koheia Horikoshiego wersji współczesnej Japonii, w której bohaterowie obdarzeni są nadnaturalnymi mocami. W drugiej części przedstawione wydarzenia sięgają nawet czwartego sezonu anime. Mamy więc do czynienia z tytułem przeznaczonym głównie dla weteranów serii, którzy nie tylko znają od podszewki mangę lub anime, ale również poprzednią część gry. W kontynuacji powróciły postacie z poprzedniej odsłony, ale dodatkowo lista rozszerzyła się o zupełnie nowe, takie jak Kai Chisaki, Mirio Togata, Tamaki Amajiki, Nejire Hado czy Mina Ashido.
Bohaterem opowieści jest ponownie Izuku Midoriya, który był jednym z (nie)szczęśliwców urodzonych bez jakichkolwiek mocy. Zrządzeniem losu otrzymuje takowe od legendarnego wojownika Toshinoriego Yagiego, znanego także jako All Might. Podobnie jak w poprzedniczce, poznajemy losy nie tylko superbohaterów, ale także ich przeciwników, wszystko w formie przerywników filmowych na silniku gry oraz animowanych scenek rodem z produkcji visual novel.